本系之學年教育以完成大學航空太空工程學系之課程計畫為主要目標。因此不論在課程設計、師資培訓、及實驗設備規劃上,均在使畢業的學生不論是飛行或從事地勤任務的軍官均能具備對飛行原理及相關航空工程的本職學識。另本系依學生性向所開設的專業選修科目涵蓋飛機結構方面,燃燒與噴射推進方面,導航與自控方面,空氣動力方面以及火箭太空與衛星科技等相關課程,以培訓學生之各別專長。